Quick explanation
Voici le résumé de ce que contient ce dossier sub-0003 FreeSurfer :
mri/ — volumes 3D
Les fichiers clés en .mgz (format FreeSurfer, équivalent NIfTI) :
| fichier |
contenu |
T1.mgz |
T1 conformé (base de tout) |
brain.mgz |
cerveau extrait (skull-stripped) |
aparc+aseg.mgz |
parcellisation principale— atlas DK + sous-corticaux |
aparc.a2009s+aseg.mgz |
parcellisation Destrieux (plus fine) |
aparc.DKTatlas+aseg.mgz |
atlas DKT |
wm.mgz |
masque matière blanche |
ribbon.mgz |
ruban cortical (entre white et pial) |
FLAIR.mgz |
FLAIR intégré (ton sujet a du FLAIR ✓) |
transforms/synthmorph*/ |
warps vers MNI152— clé pour matcher SimNIBS |
surf/ — surfaces corticales
Pour chaque hémisphère (lh. / rh.) :
| fichier |
contenu |
lh.pial→lh.pial.FLAIR |
surface piale (affinée avec FLAIR ✓) |
lh.white |
surface matière blanche |
lh.inflated |
surface gonflée (visualisation) |
lh.thickness |
épaisseur corticale par vertex |
lh.sphere.reg |
surface sphérique (pour registration inter-sujets) |
label/ — annotations parcellaires
| fichier |
contenu |
lh.aparc.annot |
labels DK par vertex surface |
lh.aparc.a2009s.annot |
labels Destrieux par vertex |
lh.BA*.label |
aires de Brodmann ex-vivo |
lh.cortex.label |
masque cortex pur |
stats/ — statistiques morphométriques
| fichier |
contenu |
lh.aparc.stats |
épaisseur, aire, volume par région DK |
aseg.stats |
volumes structures sous-corticales |
synthseg.vol.csv |
volumes SynthSeg (robuste) |